Årsagen til Kawasaki sygdom forstås ikke fuldt ud, men et barn kan være mere tilbøjelige til at udvikle det, hvis de arver visse gener fra deres forældre.
Infektion
Symptomerne på Kawasaki-sygdommen ligner dem på en infektion, så bakterier eller en virus kan være ansvarlig. Men indtil videre er en bakteriel eller viral årsag ikke blevet identificeret.
Da Kawasaki-sygdommen ikke er smitsom, kan den ikke overføres fra en person til en anden. Dette gør det usandsynligt, at det er forårsaget af en virus alene.
Kawasaki sygdom kan påvirke børn i alle aldre. Det kan være mere alvorligt hos børn under 1 år.
Genetik
Børnene, der udvikler Kawasaki-sygdom, kan være genetisk disponeret for den.
Dette betyder, at de gener, de arver fra deres forældre, kan gøre dem mere tilbøjelige til at få tilstanden.
En teori er, at snarere end at der er et enkelt gen, der er ansvarligt for Kawasaki-sygdommen, kan det være resultatet af mange gener, der hver især øger chancerne for, at et barn udvikler tilstanden.
Kawasaki sygdom er mere almindelig hos børn fra det nordøstlige Asien, især Japan og Korea.
Dette antyder også, at der kan være en genetisk årsag.